醫(yī)學微生物學（medical microbiology)是一門醫(yī)學的基礎學科，主要研究與醫(yī)學有關的病原微生物的生物學性狀、傳染致病的機理、免疫學的基本理論、診斷技術和特異性防治措施等，以達到控制和消滅傳染性疾病和與微生物有關的免疫性疾病，保障人類健康的目的。
醫(yī)學微生物學的內容分為五部分。（一)細菌：主要敘述細菌的形態(tài)、結構、生長繁殖、變異、致病性等生物學特性，以及理化、生物因素對細菌的影響。（二)免疫學基礎：主要闡明病原微生物和宿主機體相互作用的一般規(guī)律，傳染病的特異性預防、診斷和治療；并敘述非傳染性免疫的有關理論。（三)細菌各論：闡述醫(yī)學上重要的各種病原菌的生物學特性、致病性與免疫性、微生物檢查法和特異性防治。（四)病毒和（五)其他微生物：分別列述與醫(yī)學有關的病毒、衣原體、立克次體、支原體、螺旋體、放線菌和真菌的生物學特性、致病性與免疫性，微生物學檢查法和防治原則。
學習醫(yī)學微生物學的目的，在于了解病原微生物的生物學特性與致病性；認識人體對病原微生物的免疫作用，感染與免疫的相互關系，掌握傳染病及與微生物有關的其他疾病的診斷方法、預防和治療的基本原則，以能運用醫(yī)學微生物學的基礎理論、基本知識和基本技能，為今后學習有關基礎醫(yī)學和臨床醫(yī)學打下基礎。
