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DNA重組實(shí)驗(yàn)中常用的技術(shù)

 

  (二)大腸桿菌感受態(tài)的制備及重組DNA的轉(zhuǎn)化

  1.感受態(tài)的制備

 。1)接種單菌落于2ml LB培養(yǎng)液中, 37℃過(guò)夜。

 。2)取0.25ml過(guò)夜菌入25ml LB培養(yǎng)液中,37℃振搖4~6h至A590=0.4~0.6。

 。3)倒入50ml管內(nèi),水浴10min,以2500~3000rpm離心5min,棄上清。

 。4)緩慢加入75mmol/L預(yù)冷CaCl25ml懸浮菌體,冰浴20min,同上離心棄上清。

 。5)緩慢加入75mmol/L預(yù)冷CaCl21.0ml輕輕混勻后分裝在1.5ml Eppendorf管中,每管200μl,冰浴1~2h。

  2.重組DNA的轉(zhuǎn)化

 。1)將3只Eppendorf管按下列轉(zhuǎn)化項(xiàng)目作好標(biāo)記,然后按下述進(jìn)行:

轉(zhuǎn)化項(xiàng)目 受體菌 DNA 總體積
DNA對(duì)照組 0 10μl 200μl
受體菌對(duì)照組 200μl 0 200μl
轉(zhuǎn)化組 190μl 10μl 200μl

  (2)冰浴30min至1h。中間搖動(dòng)3次,以防受體菌沉底。

  (3)42℃90s。

  (4)37℃水浴5min。

 。5)加入無(wú)相應(yīng)抗生素的Lb 200μl,混勻后,37℃水浴30~60min。

 。6)分別取3組反應(yīng)物各50μl在含相應(yīng)抗生素的固體LB培養(yǎng)基平皿上涂布,室溫下干燥,然后倒置于37℃溫箱中培養(yǎng)過(guò)夜。

 。ㄈ)轉(zhuǎn)化子DNA的快速鑒定-快速細(xì)胞破碎法

 。1)挑取轉(zhuǎn)化平板上的單菌接種于含相應(yīng)抗生素的2ml LB中,37℃振蕩培養(yǎng)至A590值為0.6~0.8。

  (2)取1ml菌液至1.5ml Eppendorf管中,9000rpm離心9min,去盡上清。

 。3)加入70μl Cracking Gel緩沖液[1mol/L Tris –HCl(pH6.8)10ml,20%SDS 10ml, 250mmol/L EDTA 1.6ml,蔗糖27.2g, 1.2%溴酚藍(lán)1.67ml,加雙蒸水至200ml],混勻后,37℃水浴30min以上。

 。4)15000rpm離心15min。

 。5)吸取上清點(diǎn)樣電泳,觀察。

  (四)轉(zhuǎn)化子DNA的酶切鑒定

  1.轉(zhuǎn)化子DNA的快速少量抽提

 。1)同本節(jié) 二.(三).1.

 。2)菌液移至5ml Eppendorf 管中,9000rpm,離心9min,去上清。

 。3)加溶液Ⅰ100μl,溶液Ⅱ200μl,溶液Ⅲ150μl,混勻,冰浴10min。

  (4)15000rpm離心15min。

  (5)吸取上清,加入異丙醇1ml混勻,置室溫15~30min。

  (6)15000rpm離心15min,棄上清,加入75%乙醇洗滌2次。

 。7)離心棄上清,真空抽干,加入適量1×TE溶解DNA。

 。8)取少量DNA電泳,觀察濃度。

  2.轉(zhuǎn)化子DNA的小量酶切鑒定  同質(zhì)粒DNA的小量酶切鑒定,見(jiàn)本節(jié) 一(三)。

 。ㄎ)重組子DNA的進(jìn)一步鑒定

  可用Southern印跡雜交法或斑點(diǎn)雜交法等進(jìn)一步鑒定,詳見(jiàn)本節(jié) 四。

  [附]電泳洗脫法回收酶切DNA片段

  (1)用合適的酶切割DNA并電泳。

 。2)于紫外燈下從凝膠上切下所要的DNA帶,裝入含1×TBE緩沖液的透析代內(nèi),用夾子封好袋口,并檢查有無(wú)漏孔。

 。3)將透析袋(縱長(zhǎng))與兩極間的邊線垂直放于電泳槽內(nèi)電泳,4~5V/cm電泳至DNA貼緊袋壁。

  (4)取出透析袋,擠出凝膠塊,吸出袋內(nèi)液體放入1.5ml的離心管內(nèi),10000rpm離心5min。

 。5)吸出上清放入離心管內(nèi),加入等體積的飽和酚和等體積的氯仿,振蕩混勻,10000rpm離心5min,吸出上清放入新的離心管內(nèi)。

 。6)加入1/10體積的3mol/L AaAc,2倍體積預(yù)冷的無(wú)水乙醇,于-20℃放置4~5h。

  (7)于4℃,10000rpm離心15min,棄上清。

 。8)用75%的酒精洗滌2次,每次均于4℃,10000rpm離心5min,棄上清。

 。9)真空抽干,并用適量1×TE溶解沉淀。如此即得所需DNA片段。

  三、地高辛配基隨機(jī)標(biāo)記DNA探針?lè)?/P>

  (一)概述

  基因診斷是以核酸分子雜交技術(shù)為基礎(chǔ),在核酸水平檢測(cè)人類(lèi)遺傳性疾病的基因缺陷和一些傳染病病原體的方法。其基本過(guò)程是:制備DNA探針,標(biāo)記探針,檢測(cè)樣本。開(kāi)展這項(xiàng)工作的關(guān)鍵是要得到高靈敏度、高特異性的探針。以往人們是用放射性同位素來(lái)標(biāo)記探針DNA。近年來(lái),非同位素標(biāo)記方法發(fā)展很快,已有取代同位素標(biāo)記法的趨勢(shì)。地高辛配基隨機(jī)標(biāo)記DNA探針?lè),是較為成功的一種非同位素標(biāo)記方法。其原理是:用化學(xué)方法把類(lèi)固醇類(lèi)半抗原地高辛分子連接在dUTP上(Dig-dUTP)。用隨機(jī)引物及DNA多聚酶,以探針DNA為模板,合成互補(bǔ)DNA,化學(xué)修飾過(guò)的dUTP同時(shí)摻入到標(biāo)記的DNA探針中。雜交后用堿性磷酸酶標(biāo)記的抗地高辛單抗與標(biāo)記探針DNA中的Dig-dUTP結(jié)合,加入顯色底物,在堿性磷酸酶作用下,轉(zhuǎn)變成深棕色或藍(lán)色的化合物。

  1.標(biāo)記 本試劑盒采用隨機(jī)引物標(biāo)記方法,可標(biāo)記少至10ng,多至3μg的DNA。能在新合成的DNA鏈每20~25個(gè)核苷酸,摻入一個(gè)Dig-dUTP,反應(yīng)時(shí)間約為1h。

  2.雜交 按標(biāo)準(zhǔn)雜交方法進(jìn)行?梢圆捎媚猃埬せ蛳跛崂w維素膜。用過(guò)的雜交液可凍存于-20℃,重復(fù)使用。

  3.免疫學(xué)檢測(cè) 封阻后,檢測(cè)反應(yīng)的第一步,抗體結(jié)合物與標(biāo)記DNA結(jié)合,出現(xiàn)雜交的半抗原-標(biāo)記DNA,顯色反應(yīng)起始是在堿性pH條件下加入無(wú)色的顯色劑X-磷酸鹽和NBT,在幾分鐘內(nèi)便開(kāi)始出現(xiàn)藍(lán)色,顯色反應(yīng)的過(guò)程持續(xù)3d。典型的例子是在24h后終止顯色反應(yīng)。用二甲基甲酰胺洗掉尼龍膜上的顏色后,尼龍膜可重新用于雜交。

  4.應(yīng)用 地高辛配基標(biāo)記DNA探針及檢測(cè)試劑盒,能檢測(cè)0.1pg的同源DNA,能檢測(cè)1μg哺乳動(dòng)物DAN中的單拷貝基因,與放射性標(biāo)記系統(tǒng)比較,此試劑盒能快速得到實(shí)驗(yàn)結(jié)果(從DNA的標(biāo)記和雜交至見(jiàn)到檢測(cè)結(jié)果24h內(nèi)能完成),而且消除了放射性的不安全問(wèn)題。這試劑的靈敏度與特異性使它適用于所有的雜交技術(shù)(包括DNA-印跡轉(zhuǎn)移,菌落雜交,噬菌斑雜交及原位雜交)以替代同位素標(biāo)記和放射自顯影術(shù)。

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