基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院的前身為基礎(chǔ)部，始建于1976年，2000年6月正式更名為基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院。
學(xué)院現(xiàn)有12個(gè)教研室（病理解剖學(xué)、
病理生理學(xué)、生物化學(xué)、生理學(xué)、
藥理學(xué)、組織胚胎學(xué)、微生物學(xué)、寄生蟲學(xué)、免疫學(xué)、化學(xué)、人體解剖學(xué)、核醫(yī)學(xué))和1個(gè)教研組（神經(jīng)生物學(xué))、4個(gè)教學(xué)實(shí)驗(yàn)中心（形態(tài)、機(jī)能、病原微生物與免疫、綜合實(shí)驗(yàn))、8個(gè)研究所（基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所、天然藥物研究所、生物藥物研究所、神經(jīng)生物學(xué)研究所、病理與法學(xué)研究所、臨床病毒研究所、人獸共患病研究所、放射醫(yī)學(xué)研究所)和1個(gè)研究中心（過敏與免疫)。
學(xué)院擁有一支學(xué)科、學(xué)源、學(xué)歷、職稱結(jié)構(gòu)較為合理，勤政廉政、愛崗敬業(yè)、樂于奉獻(xiàn)的教職工隊(duì)伍�，F(xiàn)有教職工223人，其中教師163人、教輔43人、技術(shù)工人7人、政工6人。教師中，具有碩士以上學(xué)位的教師150人，占教師人數(shù)的92%，其中，已取得博士學(xué)位的有60人，在讀博士16人。目前，學(xué)院有教授28人，副教授67人，講師65人，高級(jí)實(shí)驗(yàn)師11人。有全國模范教師1人，全國優(yōu)秀教師1人，全國“三八紅旗手”1人，江淮十大女杰1人，省“三八紅旗手”1人，省十佳女教育工作者1人，省級(jí)勞動(dòng)模范6人，省級(jí)優(yōu)秀共產(chǎn)黨員1人，省級(jí)教學(xué)名師4人，省級(jí)教壇新秀5人。
近年來，學(xué)院涌現(xiàn)出一大批優(yōu)秀人才，2人入選“教育部新世紀(jì)優(yōu)秀人才支持計(jì)劃”；4人為省學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人；13人入選省學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人后備人選；4人為省高�！笆鍍�(yōu)秀人才計(jì)劃”拔尖人才；10人入選省高校學(xué)科帶頭人培養(yǎng)對(duì)象；5人獲安徽省杰出青年基金。1991年以來，先后有49人享受國務(wù)院或省政府特殊津貼。
學(xué)院現(xiàn)有省級(jí)實(shí)驗(yàn)室1個(gè)，省級(jí)重點(diǎn)學(xué)科4個(gè)，省級(jí)實(shí)驗(yàn)示范中心4個(gè)，省級(jí)實(shí)訓(xùn)中心2個(gè)；病理學(xué)科為國家級(jí)特色專科，生物技術(shù)專業(yè)為省級(jí)特色專業(yè)；2個(gè)博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)學(xué)科
quanxiangyun.cn，10個(gè)碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)學(xué)科；9門省級(jí)本科教學(xué)精品課程、1門省級(jí)研究生教學(xué)精品課程。2004年以來，承擔(dān)各類科研項(xiàng)目數(shù)逐年攀升，其中包括1項(xiàng)973子課題、57項(xiàng)國家自然基金項(xiàng)目（包括1項(xiàng)重大研究計(jì)劃)。2004年來發(fā)表學(xué)術(shù)論文1366篇，其中SCI源期刊246篇，核心期刊815篇，統(tǒng)計(jì)源期刊305篇；出版專著50部、主編參編教材242人次；獲國家發(fā)明專利4項(xiàng)；獲省部級(jí)科研成果獎(jiǎng)17項(xiàng)，廳級(jí)科研成果獎(jiǎng)7項(xiàng)。
