1907年5月，德籍醫(yī)師埃里希·寶隆博士等人創(chuàng)建上海德文醫(yī)學(xué)堂。埃里希·寶隆任校長(zhǎng)。校址設(shè)在上海白克路（今鳳陽路)。
1908年改名為同濟(jì)德文醫(yī)學(xué)堂。
1912年增設(shè)工科。
1917年4月，改屬華人私立學(xué)校，由華人董事會(huì)辦學(xué)。同年12月，更名為私立同濟(jì)醫(yī)工專門學(xué)校。1922年由市區(qū)遷往近郊吳松鎮(zhèn)。
1924年5月20日，經(jīng)南京國民政府教育部批準(zhǔn)，改名為同濟(jì)醫(yī)工大學(xué)。
1927年8月，由南京國民政府教育部接管，命名為國立同濟(jì)大學(xué)，原醫(yī)、工兩科分別改名為醫(yī)學(xué)院、工學(xué)院。1937年又先后增設(shè)了文、理、法等學(xué)院，從而成為一所多科性的綜合大學(xué)。
1949年8月，同濟(jì)大學(xué)校務(wù)委員會(huì)成立，唐哲任校務(wù)委員會(huì)常務(wù)委員兼醫(yī)學(xué)院院長(zhǎng)。1950年2月，中央人民政廳政務(wù)院決定，國立同濟(jì)大學(xué)醫(yī)學(xué)院及其附屬同濟(jì)醫(yī)院內(nèi)遷武漢，與武漢大學(xué)醫(yī)學(xué)院合并，命名為“中南同濟(jì)醫(yī)學(xué)院”，由中南軍政委員會(huì)衛(wèi)生部主管。同年10月，300多名師生積極報(bào)名參加醫(yī)療隊(duì)，為抗美援朝志愿軍服務(wù)。
1955年8月更名為武漢醫(yī)學(xué)院。
1985年學(xué)校更名為同濟(jì)醫(yī)科大學(xué)。
2000年6月25日，同濟(jì)醫(yī)科大學(xué)和華中理工大學(xué)、武漢城建學(xué)院合并，武漢科技職工大學(xué)（科技部管理學(xué)院)并入，組建華中科技大學(xué)。6月16日，成立華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院。
