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一種檢測多種傳染病的檢測型基因芯片及應(yīng)用

公開(公告)號 CN1195070C  
公開(公告)日 2005.03.30  
申請(專利)號 CN03113427.0  
申請日期 2003.05.09  
專利名稱 一種檢測多種傳染病的檢測型基因芯片及應(yīng)用  
主分類號 C12Q1/68  
分類號 C12Q1/68  
分案原申請?zhí)?  
優(yōu)先權(quán)  
申請(專利權(quán))人 陶開華;李越希  
發(fā)明(設(shè)計(jì))人 陶開華;李越希;張錦海  
地址 210002 江蘇省南京市中山東路293號南京軍區(qū)軍事醫(yī)學(xué)研究所  
頒證日  
國際申請  
進(jìn)入國家日期  
專利代理機(jī)構(gòu) 南京蘇科專利代理有限責(zé)任公司  
代理人 奚勝元  
國省代碼 江蘇;32  
主權(quán)項(xiàng) 一種檢測多種傳染病的檢測型基因芯片,其特征在于芯片包括(1)多種傳染病的多種檢測寡核苷酸探針和質(zhì)量控制寡核苷酸探針;(2)寡核苷酸探針通過手臂分子固化在載體材料上形成的探針陣列;所謂的多種傳染病的檢測型基因芯片是指檢測流行性出血熱恙蟲病、鉤端螺旋體病、血吸蟲病瘧疾、霍亂、大腸桿菌0157:H7引起的出血性腸炎七種病的寡核苷酸陣列;所謂的寡核苷酸探針是指能與目的基因雜交的多聚核苷酸,長度在十到五十個(gè)堿基;所謂的檢測寡核苷酸探針是指化學(xué)合成的多種重要傳染病病原體的基因保守區(qū)、毒力因子序列、基因型及亞型的互補(bǔ)的寡聚核苷酸,毒力因子序列探針包括了病原體致病所必須的多種基因序列的探針,基因型及亞型決定區(qū)的探針包括多種基因型和和多種亞型探針;所謂的質(zhì)量控制探針至少包括二種探針,即陽性對照,陰性對照;陰性對照用于檢測雜交信號錯(cuò)誤或污染,陽性對照用于檢測是否正常雜交和準(zhǔn)確定位;所謂的手臂分子指具有雙活性基團(tuán)的長鏈有機(jī)化合物;所謂的寡核苷酸探針固定為寡聚核苷酸的末端有一特定基團(tuán),固化在載體材料基質(zhì)表面時(shí),與表面修飾的手臂分子的末端基團(tuán)形成共價(jià)鍵;7種病原體的14個(gè)特異性基因探針如下:流行性出血熱病毒S基因探針2個(gè):HantProbe2:5’NH2-TTTTTTTTTTACCAAGGAGGCTAACTGCTGCTGTAT3’負(fù)鏈R22Probe1:5’NH2-TTTTTTTTTTCATGATCGGGAGAGTGTCGCAGCTT3’正鏈恙蟲病立克次體56KD蛋白基因探針1個(gè):OrientProbe:5’NH2-TTTTTTTTTTTTCAGCTAGTGCGATAGAATTGGGTGA3’正鏈鉤端螺旋體23SrDNA基因探針1個(gè):LepProbe1:5’NH2-TTTTTTTTTTCATGAACTTTGGGGCCTTAAACGACG3’負(fù)鏈血吸蟲5D抗原基因探針1個(gè):SchiProbe1:5’NH2-TTTTTTTTTTAGTCATCTCAACAGGTCAGCATATTG3’正鏈瘧原蟲ssrRNA基因探針2個(gè):間日瘧原蟲PvProbe2:5’NH2-TTTTTTTTTTTAGCAAAATGCGCACAAAGTCGATACG3’負(fù)鏈惡型瘧原蟲PfProbe2:5’NH2-TTTTTTTTTTATGAACTCAATCATGACTACCCGTCTG3’負(fù)鏈霍亂弧菌基因探針3個(gè):外膜蛋白o(hù)mpWprobe1:5’NH2-TTTTTTTTTTTTGCCTCGGTAGTACCTAATGACAGTA3’正鏈外膜蛋白o(hù)mpWprobe2:5’NH2-TTTTTTTTTTTTAGTTTTGAAGTCCTCGCTCGTACGCCA3’正鏈霍亂毒素基因CtxProbe2:5’NH2-TTTTTTTTTTTATATTTGGGAGTATGGAATCCCACCT3’負(fù)鏈大腸桿菌0157:H7基因探針4個(gè):0157Probe1:5’NH2-TTTTTTTTTTGGTGGAATGGTTGTCACGAATGACAAA3’正鏈H7Probe1:5’NH2-TTTTTTTTTTGACGATGCAGGCAACTTGACGACTAA3’正鏈Vt2Probe2:5’NH2-TTTTTTTTTTAGATGGTCAAAACGCGCCTGATAGAC3’負(fù)鏈Vt1Probe:5’NH2-TTTTTTTTTTGGATGACGTAACCATTAAAACTAATGCC3’正鏈  
摘要 本發(fā)明一種檢測多種傳染病的檢測型基因芯片及應(yīng)用涉及的技術(shù)領(lǐng)域是醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)和基因芯片技術(shù)。是一種用于傳染病檢測的基因芯片,對流行性出血熱、恙蟲病、鉤端螺旋體病、血吸蟲病、瘧疾、霍亂、0157∶H7引起的出血性腸炎等7種主要傳染病進(jìn)行檢測、分型或鑒定毒株。分別從流行性出血熱病毒的S基因、東方立克次體的56KD蛋白基因、鉤端螺旋體的23SRNA基因、血吸蟲的5D抗原基因、瘧原蟲的SSrRNA基因、大腸桿菌0157∶H7的0157抗原基因、H7抗原基因及毒素基因、霍亂孤菌的外膜OWP蛋白基因及毒素基因內(nèi)選擇特異性的基因探針和PCR引物。其特征在于芯片包括:(1)多種傳染病的多種檢測寡核苷酸探針和質(zhì)量控制寡核苷酸探針;(2)寡核苷酸探針通過手臂分子固化在載體材料上形成的探針陣列。  
國際公布  
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