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對大腸桿菌O172型的O-抗原特異的核苷酸

公開(公告)號 CN1249236C  
公開(公告)日 2006.04.05  
申請(專利)號 CN03109589.5  
申請日期 2003.04.15  
專利名稱 對大腸桿菌O172型的O-抗原特異的核苷酸  
主分類號 C12N15/31(2006.01)I  
分類號 C12N15/31(2006.01)I;C12N15/11(2006.01)I;C07H21/00(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I;C12Q1/04(2006.01)I;G01N33/569(2006.01)I  
分案原申請?zhí)?  
優(yōu)先權(quán)  
申請(專利權(quán))人 南開大學(xué)  
發(fā)明(設(shè)計(jì))人 王 磊;郭宏杰;馮 露  
地址 300071天津市南開大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院  
頒證日  
國際申請  
進(jìn)入國家日期  
專利代理機(jī)構(gòu) 天津三元專利商標(biāo)代理有限責(zé)任公司  
代理人 胡婉明  
國省代碼 天津;12  
主權(quán)項(xiàng) 一種對大腸桿菌O172型的O-抗原特異的寡核苷酸,其特征在于,其寡核苷酸對是:SEQIDNO:1中的1166至1182堿基的核苷酸和1854至1870堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的1415至1434堿基的核苷酸和2286至2303堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的1157至1174堿基的核苷酸和1934至1951堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的2610至2627堿基的核苷酸和3452至3470堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的2711至2728堿基的核苷酸和3460至3477堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的2742至2759堿基的核苷酸和3480至3496堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的3660至3677堿基的核苷酸和4255至4274堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的3728至3745堿基的核苷酸和4296至4313堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的3752至3769堿基的核苷酸和4308至4325堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的4391至4410堿基的核苷酸和5211至5228堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的4463至4470堿基的核苷酸和5271至5289堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的4515至4530堿基的核苷酸和5396至5418堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的5435至5452堿基的核苷酸和5992至6009堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的5687至5704堿基的核苷酸和6230至6247堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的5724至5741堿基的核苷酸和6319至6336堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的9825至9842堿基的核苷酸和10687至10704堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的10001至10017堿基的核苷酸和10682至10699堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的10201至10218堿基的核苷酸和10954至10971堿基的核苷酸。  
摘要 本發(fā)明提供一種對大腸桿菌O172型(Escherichia coli O172)的O-抗原特異的核苷酸,它是大腸桿菌O172型中控制O-抗原合成的基因簇的核苷酸全序列,如SEQ ID NO:1所示的分離的核苷酸,全長12850個堿基;或者具有一個或多個插入、缺失或取代的堿基,同時(shí)保持所述分離的核苷酸功能的SEQ IDNO:1的核苷酸;還包括源于大腸桿菌O172型的O-抗原基因簇中的糖基轉(zhuǎn)移酶基因和寡糖單位處理基因的寡核苷酸;本發(fā)明通過PCR證實(shí)寡核苷酸對大腸桿菌O172型的O-抗原都有高度的特異性;本發(fā)明還公開了用本發(fā)明的寡核苷酸檢測和鑒定人體及環(huán)境中的大腸桿菌O172型的方法。  
國際公布  
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