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病原微生物診斷型基因芯片的快速檢測(cè)方法

公開(kāi)(公告)號(hào) CN1289691C  
公開(kāi)(公告)日 2006.12.13  
申請(qǐng)(專利)號(hào) CN03113853.5  
申請(qǐng)日期 2003.03.04  
專利名稱 病原微生物診斷型基因芯片的快速檢測(cè)方法  
主分類號(hào) C12Q1/68(2006.01)I  
分類號(hào) C12Q1/68(2006.01)I;C12Q1/04(2006.01)I  
分案原申請(qǐng)?zhí)?  
優(yōu)先權(quán)  
申請(qǐng)(專利權(quán))人 中國(guó)人民解放軍基因工程研究所  
發(fā)明(設(shè)計(jì))人 馬文麗;鄭文嶺;石 嶸  
地址 510515廣東省廣州市同和第一軍醫(yī)大學(xué)分子生物學(xué)研究所  
頒證日  
國(guó)際申請(qǐng)  
進(jìn)入國(guó)家日期  
專利代理機(jī)構(gòu) 廣州知友專利商標(biāo)代理有限公司  
代理人 邵毓琴  
國(guó)省代碼 廣東;44  
主權(quán)項(xiàng) 病原微生物診斷型基因芯片的快速檢測(cè)方法,包括以下步驟:(1)玻片的準(zhǔn)備;(2)探針準(zhǔn)備:采用PCR擴(kuò)增病原體全基因組的各個(gè)基因和特異性片段,探針長(zhǎng)度從數(shù)百到數(shù)千堿基不等,濃度在0.25~0.5μg/μL;(3)芯片制備:采用基因芯片點(diǎn)樣儀進(jìn)行點(diǎn)樣;(4)打印后處理;(5)樣品的處理:在PCR擴(kuò)增過(guò)程中,采用Cy5-dUTP進(jìn)行摻入標(biāo)記,在標(biāo)記前或標(biāo)記后采用Sau3A I進(jìn)行限制性酶切,使獲得片段長(zhǎng)度在200~600bps之間;其中,標(biāo)記dNTP的配制為:三種dNTP的摩爾終濃度與另一種欲用熒光標(biāo)記物替代的dNTP的摩爾終濃度比為5∶3,而熒光標(biāo)記物cy5-dUTP與和其競(jìng)爭(zhēng)性摻入的dTTP的摩爾濃度比是1∶3;(6)雜交:2×雜交緩沖液的配方為60%甲酰胺、12×SSC、0.24%SDS;(7)雜交后清洗;(8)掃描檢測(cè)。  
摘要 本發(fā)明公開(kāi)了一種病原微生物診斷型基因芯片的快速檢測(cè)方法,包括以下步驟:(1)玻片的準(zhǔn)備;(2)探針準(zhǔn)備:采用PCR擴(kuò)增病原體全基因組的各個(gè)基因和特異性片段,探針長(zhǎng)度從數(shù)百到數(shù)千堿基不等,濃度在0.25~0.5μg/μL;(3)芯片制備:采用基因芯片點(diǎn)樣儀進(jìn)行點(diǎn)樣;(4)打印后處理;(5)樣品的處理:在PCR擴(kuò)增過(guò)程中,Cy5-dUTP進(jìn)行摻入標(biāo)記,在標(biāo)記前或標(biāo)記后引入限制性酶切,使獲得片段長(zhǎng)度在200~600bps之間;(6)雜交:2×雜交明沖液的配方為60%甲酰胺、12×SSC、0.24%SDS;(7)雜交后清洗;(8)掃描檢測(cè)。本發(fā)明具有標(biāo)記效率高、雜交檢測(cè)結(jié)果穩(wěn)定、雜交時(shí)間大大病短等優(yōu)點(diǎn),可將雜交時(shí)間從傳統(tǒng)的16~20小時(shí)縮短到10分鐘,尤其適用于臨床感染性疾病的診斷。  
國(guó)際公布  
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