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原核基因表達調(diào)控

 

  在1ac操縱元的啟動子P1ac上游端有一段與Plac部分重疊的序列,能與CAP特異結(jié)合,稱為CAP結(jié)合位點(CAp binding site)。CAP與這段序列結(jié)合時,可增強RNA聚合酶的轉(zhuǎn)錄活性,使轉(zhuǎn)錄提高50倍。相反,當(dāng)有葡萄糖可供分解利用時,cAMP濃度降低,CRP不能被活化,1ac操縱元的結(jié)構(gòu)基因表達下降。

圖19-9 葡萄糖利用對乳糖操縱元的影響

  由于P1ac是弱啟動子,單純因乳糖的存在發(fā)生去阻遏使1ac操縱元轉(zhuǎn)錄開放,還不能使細胞很好利用乳糖,必須同時有CAP來加強轉(zhuǎn)錄活性,細菌才能合成足夠的酶來利用乳糖。1ac操縱元的強誘導(dǎo)既需要有乳糖的存在,又需要沒有葡萄糖可供利用。通過這種機制,細菌優(yōu)先利用環(huán)境中的葡萄糖,只有無葡萄糖而又有乳糖時,細菌才去充分利用乳糖。

  細菌對葡萄糖以外的其他糖(如阿拉伯糖、半乳糖、麥芽糖等)的利用上也有類似對乳糖利的情況,在含有編碼利用阿拉伯糖的酶類基因群的阿拉伯糖操縱元(ara operon)、半乳糖操縱元(gal operon)中也有CAP結(jié)合位點,CAP也起類似的正性調(diào)控作用。所以CAP的通用名稱是分解代謝基因激活蛋白(catabolic gene activator protein)。

  不難看出:CAP結(jié)合位點就是一種起正性調(diào)控作用的操縱子,CAP則是對轉(zhuǎn)錄起正性作用的控蛋白棗激活蛋白,編碼CRP的基因也是一個調(diào)控基因,不過它并不在1ac操縱元的附近,CAP可以對幾個操縱元都起作用。

  從上所述,乳糖操縱元屬于可誘導(dǎo)操縱元(inducible operon),這類操縱元通常是關(guān)閉的,當(dāng)受效應(yīng)物作用后誘導(dǎo)開放轉(zhuǎn)錄。這類操縱元使細菌能適應(yīng)環(huán)境的變化,最有效地利用環(huán)境能提供的能源底物。

  四、色氨酸操縱元

  色氨酸是構(gòu)成蛋白質(zhì)的組分,一般的環(huán)境難以給細菌提供足夠的色氨酸,細菌要生存繁殖通常需要自己經(jīng)過許多步驟合成色氨酸,但是一旦環(huán)境能夠提供色氨酸時,細菌就會充分利用外界的色氨酸、減少或停止合成色氨酸,以減輕自己的負擔(dān)。細菌所以能做到這點是因為有色氨酸操縱元(trp operon)的調(diào)控。

  (一)色氨酸操縱元的結(jié)構(gòu)與阻遏蛋白的負性調(diào)控

  如圖19-10所示,合成色氨酸所需要酶類的基因E、D、C、B、A等頭尾相接串連排列組成結(jié)構(gòu)基因群,受其上游的啟動子Ptrp和操縱子o的調(diào)控,調(diào)控基因trpR的位置遠離P-o-結(jié)構(gòu)基因群,在其自身的啟動子作用下,以組成性方式低水平表達分子量為47000的調(diào)控蛋白R。R并沒有與o結(jié)合的活性,當(dāng)環(huán)境能提供足夠濃度的色氨酸時,R與色氨酸結(jié)合后構(gòu)象變化而活化,就能夠與o特異性親和結(jié)合,阻遏結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄,因此這是屬于一種負性調(diào)控的、可阻遏的操縱元(repressible operon),即這操縱元通常是開放轉(zhuǎn)錄的,當(dāng)有效應(yīng)物(色氨酸為阻遏劑)作用時,則阻遏關(guān)閉轉(zhuǎn)錄。細菌不少生物合成系統(tǒng)的操縱元都屬于這種類型,其調(diào)控可使細菌處在生存繁殖最經(jīng)濟最節(jié)省的狀態(tài)。

圖19-10 色氨酸操縱元的結(jié)構(gòu)和調(diào)控示意圖

  (二)衰減子及其作用

  實驗觀察表明:當(dāng)色氨酸達到一定濃度,但還沒有高到能夠活化R使其起阻遏作用的程度時,產(chǎn)生色氨酸合成酶類的量已經(jīng)明顯降低,而且產(chǎn)生的酶量與色氨酸濃度呈負相關(guān)。仔細研究發(fā)現(xiàn)這種調(diào)控現(xiàn)象與色氨酸操縱元特殊的結(jié)構(gòu)有關(guān)。醫(yī)學(xué)全在線www.med126.com

圖19-11 色氨酸操縱元中的衰減子結(jié)構(gòu)及其調(diào)控示意圖

  在色氨酸操縱元Ptrp-o與第一個結(jié)構(gòu)基因trpE之間有162bp的一段先導(dǎo)序列(leadingsequence,L)實驗證明當(dāng)色氨酸達一定濃度時,RNA聚合酶的轉(zhuǎn)錄會終止在這里。這段序列中含有編碼由14個氨基酸組成的短肽的開放讀框,其序列中有2個色氨酸相連,在此開放讀框前有核糖體識別結(jié)合位點(RBS)序列,提示這段短開放讀框在轉(zhuǎn)錄后是能被翻譯的。在先導(dǎo)序列的后半段含有3對反向重復(fù)序列(圖19?1中A、B及C),在被轉(zhuǎn)錄生成mRNA時都能夠形成發(fā)夾式結(jié)構(gòu),但由于B的序列分別與A和C重疊,所以如果B形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),A和C都不能再形成發(fā)夾結(jié)構(gòu);相反,當(dāng)A形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)時,B就不能形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),卻有利于C生成發(fā)夾結(jié)構(gòu)。C后面緊跟一串A(轉(zhuǎn)錄成RNA就是一串U),C實際上是一個終止子,如果轉(zhuǎn)錄mRNA時它形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),就能使RNA聚合酶停止轉(zhuǎn)錄而從mRNA上脫離下來。

圖19-12 三種不同情況下A、B、C形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)的狀態(tài)

  在色氨酸未達到能起阻遏作用的濃度時,從Ptrp起始轉(zhuǎn)錄,RNA聚合酶沿DNA轉(zhuǎn)錄合成mRNA,同時核糖體就結(jié)合到新生成的mRNA核糖體結(jié)合位點上開始翻譯。當(dāng)色氨酸濃度低時,生成的tRNAtrp色氨酸量就少,能擴散到核糖體mRNA形成的翻譯復(fù)合體中供給合成短肽的幾率低,使核糖體沿mRNA翻譯移動的速度慢,趕不上RNA聚合酶沿DNA移動轉(zhuǎn)錄的速度,這時核糖體占據(jù)短開放讀框的機會較多,使A不能生成發(fā)夾結(jié)構(gòu),于是B就形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),阻止了C生成終止信號的結(jié)構(gòu),RNA聚合酶得以沿DNA前進,繼續(xù)去轉(zhuǎn)錄其后trpE等基因,trp操縱元就處于開放狀態(tài)。當(dāng)色氨酸濃度增高時,tRNAtrp色氨酸濃度隨之升高,核糖體沿mRNA翻譯移動的速度加快,占據(jù)到B段的機會增加,B生成發(fā)夾結(jié)構(gòu)的機會減少,C形成終止結(jié)構(gòu)的機會增多,RNA聚合酶終止轉(zhuǎn)錄的的幾率增加,于是轉(zhuǎn)錄減弱。如果當(dāng)其他氨基酸短缺(注意:短開放讀框編碼的14肽中多數(shù)氨基酸能由環(huán)境充分供應(yīng)的機會是不多的)或所有的氨基酸都不足時,核糖體翻譯移動的速度就更慢,甚至不能占據(jù)A的序列,結(jié)果有利于A和C發(fā)夾結(jié)構(gòu)的形成,于是RNA聚合酶停止轉(zhuǎn)錄,等于告訴細菌:“整個氨基酸都不足,即使合成色氨酸也不能合成蛋白質(zhì),不如不合成以節(jié)省能量”。

  由此可見,先導(dǎo)序列起到隨色氨酸濃度升高降低轉(zhuǎn)錄的作用,這段序列就稱為衰減子attenuator)。在trp操縱元中,對結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄阻遏蛋白的負調(diào)控起到粗調(diào)的作用,而衰減子起到細調(diào)的作用。細菌其他氨基酸合成系統(tǒng)的許多操縱元(如組氨酸、蘇氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、苯丙氨酸等操縱元)中也有類似的衰減子存在。

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