學校學歷教育以研究生和本科生培養(yǎng)為主。設(shè)有八年制臨床醫(yī)學、口腔醫(yī)學；五年制臨床醫(yī)學、口腔醫(yī)學、空軍臨床醫(yī)學、臨床醫(yī)學（康復醫(yī)學與療養(yǎng)學)；四年制生物醫(yī)學工程、藥學、藥物制劑、公共事業(yè)管理（衛(wèi)生統(tǒng)計)、生物技術(shù)、護理學等12個本科專業(yè)。函授本科專業(yè)：生物醫(yī)學工程，醫(yī)學實驗技術(shù)，公共事業(yè)管理，護理學，預防醫(yī)學，藥物制劑；夜大學：臨床醫(yī)學專業(yè)。還擔負全軍醫(yī)務(wù)干部定期輪訓。
第四軍醫(yī)大學是國家首批博士、碩士學位授權(quán)單位。學校現(xiàn)有基礎(chǔ)醫(yī)學、口腔醫(yī)學、生物醫(yī)學工程、生物學等6個博士學位授權(quán)一級學科，博士學位授權(quán)二級學科45個，碩士學位授權(quán)二級學科63個。
按照國家《授予博士、碩士學位和培養(yǎng)研究生的學科、專業(yè)目錄》，學校學科涉及6個門類，21個一級學科。其中一級分別是：哲學、理論經(jīng)濟學、政治學、教育學、心理學、外國語言文學、數(shù)學、科學技術(shù)史、生物學、計算機科學與技術(shù)、生物醫(yī)學工程quanxiangyun.cn、基礎(chǔ)醫(yī)學、臨床醫(yī)學、口腔醫(yī)學、公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學、中西醫(yī)結(jié)合、藥學、軍隊指揮學、軍事后勤學與軍事裝備學、公共管理、圖書館情報與檔案管理。
我校目前具有150多個科室（教研室)�，F(xiàn)有基礎(chǔ)醫(yī)學、臨床醫(yī)學、生物學、口腔醫(yī)學、公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學、生物醫(yī)學工程等7個博士后流動站；其中國家重點學科19個(培育4個)，國家重點實驗室1個，是西北地區(qū)唯一的生物醫(yī)學領(lǐng)域國家重點實驗室；還有全軍醫(yī)學�？浦行难芯克�25個，全軍醫(yī)學專業(yè)重點實驗室13個。有12個“211工程”三期重點學科建設(shè)項目，13個“長江學者獎勵計劃”特聘教授崗位學科，碩士學位二級授權(quán)學科63個，博士學位二級授權(quán)學科45個，全軍重點建設(shè)學科專業(yè)領(lǐng)域3個。此外，還有2個國家臨床藥理基地、1個全軍臨床藥理基地，另設(shè)中國癌癥基金會腫瘤研究所及國家“８６３”西安細胞工程中心。國家級重點學科數(shù)量在全軍院校中最多，全軍醫(yī)學研究所、醫(yī)學�？浦行臄�(shù)量、全軍醫(yī)學重點實驗室數(shù)量在全軍醫(yī)科院校中最多。
