復(fù)旦大學(xué)藥學(xué)院創(chuàng)建于1936年，是我國辦學(xué)歷史悠久、學(xué)科齊全、師資力量雄厚的著名藥學(xué)院校之一。創(chuàng)立初期名為國立上海醫(yī)學(xué)院藥學(xué)專修科，繼后分別更名為國立上海醫(yī)學(xué)院藥科、國立上海醫(yī)學(xué)院藥學(xué)院、上海第一醫(yī)學(xué)院藥學(xué)系、上海醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院。2000年4月，原上海醫(yī)科大學(xué)與復(fù)旦大學(xué)合并，遂定名為復(fù)旦大學(xué)藥學(xué)院。復(fù)旦大學(xué)藥學(xué)院為國家首批博士學(xué)位授予單位并在1998年獲得藥學(xué)一級學(xué)科博士學(xué)位授予權(quán)，1999年建立藥學(xué)一級學(xué)科博士后流動站，2002年與生命科學(xué)學(xué)院聯(lián)合設(shè)立了國家生命科學(xué)與技術(shù)人才培養(yǎng)基地—生物醫(yī)藥點(diǎn),2007年藥劑學(xué)科被遴選為國家重點(diǎn)學(xué)科，藥理學(xué)科被遴選為上海市重點(diǎn)學(xué)科。目前是全國高等醫(yī)學(xué)教育學(xué)會藥學(xué)教育研究分會副理事長單位。
藥學(xué)院下設(shè)藥物化學(xué)學(xué)科、藥劑學(xué)學(xué)科、藥理學(xué)學(xué)科和臨床藥學(xué)學(xué)科四大學(xué)科群，其中：藥物化學(xué)學(xué)科群主要由合成藥物化學(xué)、生物合成藥物化學(xué)、天然藥物化學(xué)和生藥學(xué)組成；藥劑學(xué)學(xué)科群主要由藥劑學(xué)、物理化學(xué)、放射藥學(xué)、藥物分析學(xué)組成；藥理學(xué)學(xué)科群主要由藥理學(xué)和生物化學(xué)組成；臨床藥學(xué)學(xué)科群主要由臨床藥學(xué)和藥事管理學(xué)組成。擁有一個(gè)本科實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心、七個(gè)技術(shù)支撐平臺（國家重大創(chuàng)制新藥專項(xiàng)綜合性大平臺、抗病毒藥物篩選與藥效評估技術(shù)平臺醫(yī).學(xué)全.在.線網(wǎng)站quanxiangyun.cn、新制劑與新釋藥系統(tǒng)技術(shù)平臺、GLP實(shí)驗(yàn)動物中心和儀器測試中心、國家中醫(yī)藥管理局中藥制劑和中藥生藥分析三級實(shí)驗(yàn)室)、衛(wèi)生部上海市臨床藥學(xué)研究與培訓(xùn)中心、《中國臨床藥學(xué)雜志》社�，F(xiàn)有教職員工134人，其中正高職稱教師（教授、研究員)23人，副高職稱教師（副教授、副研究員)27人。其中，博士生導(dǎo)師23名、碩士生導(dǎo)師25名。
藥學(xué)院作為復(fù)旦大學(xué)藥學(xué)學(xué)科的主體，學(xué)校給予了重點(diǎn)建設(shè)。在“985”一、二、三期和“211”三期建設(shè)中，藥學(xué)院在科研支撐條件、人才和整體科研實(shí)力方面均有顯著提高。引進(jìn)‘千人計(jì)劃’特聘教授（3人)等一批優(yōu)秀人才。近年來，藥學(xué)院在教學(xué)、科研和新藥研發(fā)領(lǐng)域發(fā)展勢頭強(qiáng)勁，取得了“國家重點(diǎn)學(xué)科”、“國家教學(xué)成果二等獎(jiǎng)”、“全國百篇優(yōu)秀博士論文”、“國家精品課程”、“國家重大創(chuàng)制新藥綜合性大平臺、單元平臺、關(guān)鍵技術(shù)和侯選藥物”、“國家重大科學(xué)研究計(jì)劃項(xiàng)目(973)的首席科學(xué)家(2位)”、“國家自然基金委杰出青年基金(2項(xiàng))”等國家級重大項(xiàng)目/成果。近期，又獲得教育部和總后智能化給藥重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的建設(shè)立項(xiàng)。學(xué)院的國內(nèi)外交流與合作活躍，成為復(fù)旦大學(xué)14個(gè)進(jìn)入ESI學(xué)科之一。學(xué)院教授開始在國際重要學(xué)術(shù)期刊上擔(dān)任副主編和編委，我院的國際影響力逐年提升。
藥學(xué)院已于2009 年初整體搬遷張江新址，地處“中國藥谷”，迎來了學(xué)院建設(shè)的快速發(fā)展和再次騰飛的新機(jī)遇！
