學(xué)院在化學(xué)生物學(xué)與藥學(xué)院的牌子下履行本科生和研究生教學(xué)功能，在首都醫(yī)科大學(xué)藥物研究所的牌子下履行新藥研究功能。啟動了一支隊伍兩種功能的運作模式。
按照現(xiàn)代藥學(xué)的學(xué)科規(guī)范，學(xué)院設(shè)立了藥物化學(xué)系、藥劑學(xué)系、新藥藥理學(xué)系、化學(xué)生物學(xué)系、天然藥物學(xué)系、臨床藥學(xué)系和藥學(xué)實驗教學(xué)中心。
建設(shè)一支素質(zhì)好的師資隊伍既是學(xué)院的近期目標(biāo)，又是學(xué)院的長期目標(biāo)。師資隊伍建設(shè)統(tǒng)籌考慮人品、學(xué)術(shù)、學(xué)位、年齡和學(xué)科五個因素，按照研究教學(xué)型藥學(xué)院的發(fā)展思路，學(xué)院教職員將控制在90人以內(nèi)，學(xué)院現(xiàn)有教職員46人，其中正高級職稱7人，占總?cè)藬?shù)的15.2%；副高級職稱14人，占總?cè)藬?shù)的30.4%；博士生導(dǎo)師4人，占總?cè)藬?shù)的8.7%；碩士生導(dǎo)師13人，占總?cè)藬?shù)的28.3%；26人具有博士學(xué)位，占總?cè)藬?shù)的56.5%.
目前學(xué)院在讀本科生、碩士研究生、博士研究生總計300余人，按照研究教學(xué)型學(xué)院的發(fā)展思路，我院的本科教育主要為制藥企業(yè)和社會藥房培養(yǎng)普通職員、為大學(xué)和研究院所輸送碩士研究生。碩士生教育主要為制藥企業(yè)培養(yǎng)中級職員、為大學(xué)和研究院所輸送博士研究生。2011年，學(xué)院本科生、研究生就業(yè)率均為100%，被評為學(xué)校就業(yè)工作先進(jìn)集體。
化學(xué)生物學(xué)與藥學(xué)院在學(xué)校的統(tǒng)一規(guī)劃下采用了醫(yī)學(xué)+生物學(xué)+化學(xué)的辦學(xué)模式，在理科性、應(yīng)用性和職業(yè)性一體化的辦學(xué)理念的指導(dǎo)下，學(xué)院以系為建制進(jìn)行學(xué)科融合，按一級學(xué)科設(shè)課的寬口徑培養(yǎng)，實施低年級學(xué)生導(dǎo)師制，在強調(diào)基礎(chǔ)性、綜合性、設(shè)計性和先進(jìn)性的前提下，培養(yǎng)創(chuàng)新能力。使畢業(yè)生在就業(yè)競爭中處于領(lǐng)先位置，為今后持續(xù)發(fā)展打好基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)全在線網(wǎng)站www.med126.com。特色的辦學(xué)理念使學(xué)院畢業(yè)生在就業(yè)競爭中處于領(lǐng)先位置，并為今后持續(xù)發(fā)展打好基礎(chǔ)，多年來就業(yè)率均達(dá)100%，近一半的本科生成功考研，選擇繼續(xù)深造。獲北京市教育教學(xué)成果二等獎1項。
建設(shè)一流學(xué)科是創(chuàng)建一流化學(xué)生物學(xué)與藥學(xué)院的基石。學(xué)院在學(xué)科建設(shè)中采取重點發(fā)展以優(yōu)勢學(xué)科帶頭人為支撐的優(yōu)勢學(xué)科、優(yōu)先扶持新興學(xué)科的學(xué)科建設(shè)策略。著力在國外知名雜志上發(fā)表學(xué)術(shù)論文及申請國家發(fā)明專利，是學(xué)院科研的主導(dǎo)思路。2004年至2011年間獲國家973項目1項，“十一五國家重大新藥創(chuàng)制科技重大專項”3項，參與“十二五國家重大新藥創(chuàng)制科技重大專項”1項，國家自然科學(xué)基金14項，北京市自然科學(xué)基金12項，北京市教委基金19項，其中重點項目3項，共發(fā)表SCI論文146篇，申請發(fā)明專利230項，授權(quán)發(fā)明專利77項，獲北京市科學(xué)技術(shù)進(jìn)步二等獎一項，建立了“多肽及小分子藥物”北京市重點實驗室，獲批建設(shè)教育部“內(nèi)源式預(yù)防藥物教育部工程研究中心”。
目前，學(xué)院正著力構(gòu)建科學(xué)目標(biāo)與產(chǎn)品目標(biāo)兼顧、中西藥研究并重、基礎(chǔ)研究與應(yīng)用研究有機結(jié)合的科研格局。今后將重點針對心腦血管疾病、腫瘤及老年性疾病等三大疾病，大力發(fā)展新藥研究體系。
