福建中醫(yī)藥大學原名福建中醫(yī)學院，創(chuàng)建于1958年，是我國創(chuàng)辦較早的高等中醫(yī)藥院校之一，是福建省重點建設高校，2010年3月經(jīng)教育部批準更名為福建中醫(yī)藥大學。
學校設有13個學院（部)，2個研究院；有中醫(yī)學、中西醫(yī)結(jié)合等2個博士學位授權(quán)一級學科，有14個博士學位授權(quán)點，有臨床醫(yī)學、中醫(yī)學、中西醫(yī)結(jié)合、藥學、中藥學、護理學等6個碩士學位授權(quán)一級學科，有41個碩士學位授權(quán)點，有臨床醫(yī)學、中藥學等2個碩士專業(yè)學位類別；有中醫(yī)學、七年制中醫(yī)學、針灸推拿學、中西醫(yī)臨床醫(yī)學、臨床醫(yī)學、醫(yī)學影像學、藥學、中藥學、藥物制劑、制藥工程、市場營銷、護理學、公共事業(yè)管理、應用心理學、食品科學與工程、康復治療學、信息管理與信息系統(tǒng)等34個本科專業(yè)及方向�，F(xiàn)有全日制在校生1萬多人，其中研究生1000多人。
學�，F(xiàn)有教職醫(yī)護員工2500多人，其中具有高級職稱的專業(yè)技術(shù)人員500多人；擁有一批國家有突出貢獻的中青年專家、國務院特殊津貼專家、國家級名老中醫(yī)學術(shù)繼承人指導老師、全國百名杰出青年中醫(yī)、全國優(yōu)秀教師等。
2002年和2007年，學校先后兩次在教育部組織的本科教學工作水平評估中獲得“優(yōu)秀”成績。2010年12月，學校順利通過了教育部專家組對我校的中醫(yī)學專業(yè)試點認證。目前，學校擁有3門國家級精品課程、2個國家級教學團隊、4個國家級特色專業(yè)、1門國家級雙語教學示范課程、1個國家級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)和1門國家級精品視頻公開課。在近兩屆教學成果評選中獲國家級二等獎1項quanxiangyun.cn，省級特等獎2項、一、二等獎5項。
學校有11個國家中醫(yī)藥管理局重點學科，12個省級重點學科。2003年以來，作為福建省重點建設高校之一，學校以學科建設為核心，帶動其它相關內(nèi)涵建設的發(fā)展，取得顯著成績。2008年，學校再次被列入福建省重點建設高校。
學校有1個省部共建教育部重點實驗室，8個國家（局級)三級科研實驗室，2個省級重點實驗室。先后有410項科研成果受到國家和省市的獎勵，其中國家級科研成果獎12項。近5年來，學校進一步推進科技創(chuàng)新，加大科研投入，共承擔科研課題1355項，其中國家級項目74項，省部級項目300項；獲省部級以上獎勵46項。2009年以來榮獲國家自然科學基金項目61項、省級重大專項2項。
學校有4所直屬附屬醫(yī)院，6所非直屬附屬醫(yī)院，4所臨床醫(yī)學院，25所教學醫(yī)院，20所實（見)習醫(yī)院，臨床基地實力雄厚，體系健全。有康復、肛腸等2個衛(wèi)生部國家臨床重點�？疲�10個國家中醫(yī)藥管理局重點�？�、專病。校本部設立國醫(yī)堂醫(yī)院，為社會提供服務。
學校擁有兩個校區(qū)，共占地1014畝，各類建筑總面積30多萬平方米，教學科研儀器設備總值1億多元，紙質(zhì)、電子圖書文獻總量280萬冊。學校各類設施優(yōu)良，配備了現(xiàn)代化的教學、科研、行政、生活等設施，建設了富有中醫(yī)藥文化氣息的人文景觀，是一個環(huán)境優(yōu)美、文化濃郁的校園，被授予“全國中醫(yī)藥文化建設先進單位”榮譽稱號，并已連續(xù)六次被福建省委、福建省人民政府授予“文明學�！睒s譽稱號。
學校是內(nèi)地第一所招收臺灣學生的中醫(yī)藥院校quanxiangyun.cn，現(xiàn)有各類在校海外學生近300名，其中多數(shù)為臺灣學生；先后舉辦了11屆兩岸中醫(yī)藥學術(shù)研討會，形成了博士、碩士、本科、�？�、短期進修等多層次、多規(guī)格、多形式的對臺教育格局。學校還與美國、德國、澳大利亞、日本、馬來西亞、臺灣、香港等國家和地區(qū)的高等院校、科研醫(yī)療機構(gòu)、學術(shù)團體建立了穩(wěn)定的合作關系。
在新的發(fā)展階段，學校以科學發(fā)展觀為指導，秉承“大醫(yī)精誠，止于至善”的校訓精神，進一步更新觀念，開拓進取，努力把學校建設成為一所以中醫(yī)藥為主體，多學科協(xié)調(diào)發(fā)展，服務海峽西岸經(jīng)濟區(qū)，具有鮮明辦學特色的教學研究型中醫(yī)藥大學。