同時開展多器官聯(lián)合移植，施行肝腎聯(lián)合移植25例，為國內(nèi)移植數(shù)量最多，其中最長生存已13年，創(chuàng)國內(nèi)存活最長記錄；施行胰腎聯(lián)合移植，現(xiàn)最長存活18年，目前患者腎、胰功能均正常，創(chuàng)亞洲最佳紀(jì)錄。基于良好的療效，多器官聯(lián)合移植被衛(wèi)生部列為推廣項目。20年來致力于創(chuàng)新外科理念與技術(shù)，在國內(nèi)率先采用非靜脈－靜脈轉(zhuǎn)流技術(shù)；在國內(nèi)率先采用不放置T管、前壁間斷后壁連續(xù)膽總管－膽總管端端吻合的膽道重建技術(shù)
quanxiangyun.cn，有效降低移植術(shù)后膽道并發(fā)癥發(fā)生率；在國內(nèi)率先將人工肝支持系統(tǒng)應(yīng)用于
重型肝炎患者肝臟移植圍手術(shù)期治療等；在國際上首次提出了
肝癌肝移植受者選擇的“杭州標(biāo)準(zhǔn)”，擴(kuò)大了肝癌肝移植受體入選范圍,挽救了一大批終末期肝病患者。開展保留部分肝中靜脈的活體左半肝移植和不包括肝中靜脈成人活體右半肝移植,在移植中創(chuàng)新性橋接V、VIII肝靜脈技術(shù)保證了供受體的安全。創(chuàng)新性地使用小劑量乙肝
丙種球蛋白（HBIG)聯(lián)合拉米呋啶（LAM)預(yù)防方案，在大大減低費(fèi)用的同時，使得一年乙肝復(fù)發(fā)率從27.4%降為13.5%，該項研究成果發(fā)表于《Liver Transplantation》，被密歇根大學(xué)、斯坦福大學(xué)等引用。肝移植與多器官移植技術(shù)取得了系列創(chuàng)新性成果
quanxiangyun.cn，因此，鄭教授領(lǐng)銜完成的“胰十二脂腸及腎一期聯(lián)合移植”和“肝移植技術(shù)創(chuàng)新體系的建立與推廣應(yīng)用”，分別于1996年和2008年2次榮獲國家科技進(jìn)步二等獎；此外，榮獲省科學(xué)技術(shù)一等獎5項及中華醫(yī)學(xué)科技三等獎等多項國家級和省級獎項，并于2003年獲得浙江省科學(xué)技術(shù)重大貢獻(xiàn)獎。鄭教授是全國腫瘤規(guī)范化診療專家委員會顧問，并作為中國大陸唯一編審專家參與世界胃腸病組織WGO《國際肝癌診治指南》的制定。鄭教授在《
中華醫(yī)學(xué)雜志》、《中華外科雜志》等國內(nèi)權(quán)威醫(yī)學(xué)雜志上發(fā)表重要述評，積極幫助印度尼西亞大學(xué)附屬醫(yī)院、協(xié)和醫(yī)科大學(xué)協(xié)和醫(yī)院、
復(fù)旦大學(xué)華山醫(yī)院、
新疆醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院等國內(nèi)外兄弟醫(yī)院開展肝移植工作，向全國二十余個省市進(jìn)行技術(shù)輻射和技術(shù)支持。
在基礎(chǔ)研究方面，作為首席科學(xué)家連續(xù)主持我國器官移植領(lǐng)域2個國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃（“973”計劃)項目，分別為“移植臟器慢性失功的免疫學(xué)應(yīng)用基礎(chǔ)研究”（2003-2008)，“器官移植的免疫學(xué)應(yīng)用基礎(chǔ)研究”（2009-2013)，2009年起主持國家科技重大專項課題“肝癌抗復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移治療臨床新體系的研究與應(yīng)用”。此外，承擔(dān)863項目2項，國家自然科學(xué)基金創(chuàng)新群體1項、重點(diǎn)項目1項，教育部長江學(xué)者和創(chuàng)新團(tuán)隊發(fā)展計劃1項，國家十五攻關(guān)項目1項，衛(wèi)生部行業(yè)專項基金1項等。在國內(nèi)外期刊上發(fā)表論文400余篇,其中作為第一或通訊作者在《Liver Transplantation》、《Transplantation》等SCI期刊發(fā)表論文160余篇。主編教育部規(guī)劃《外科學(xué)》五年制、八年制及專升本教材, 主編《肝臟移植》、《胰腺移植》、《肝臟移植圍手術(shù)期處理》等移植專著；2002年9月創(chuàng)辦并主編國內(nèi)首本肝膽胰疾病領(lǐng)域的英文雜志《HBPD INT》(SCI 收錄)，2003年11月創(chuàng)辦并主編《中華移植雜志》（電子版)雜志。先后培養(yǎng)培養(yǎng)博士后6人，博士生、碩士生共160余名，為我國器官移植和多器官聯(lián)合移植領(lǐng)域培養(yǎng)了一大批的優(yōu)秀人才。
鄭樹森教授先后獲 “全國先進(jìn)工作者”、“國家級有突出貢獻(xiàn)的中青年專家”、“全國優(yōu)秀留學(xué)回國人員”、“全國優(yōu)秀院長”、“浙江省有突出貢獻(xiàn)中青年科技人員”、“浙江省醫(yī)學(xué)杰出中青年科技人員”、 “浙江省勞動模范”、“浙江省高校優(yōu)秀共產(chǎn)黨員”、“浙江省高等學(xué)校教學(xué)名師獎”、“浙江省十佳優(yōu)秀科技工作者” 等榮譽(yù)稱號。
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