南京醫(yī)科大學(xué)第四臨床醫(yī)學(xué)院淵源于 “江蘇醫(yī)學(xué)院”1953年成立的兒科學(xué)教研組。同年，開始招收兒科學(xué)五年制本科生。1959年12月成立兒科系。1962年起始招收三年制碩士研究生。1981年“兒科學(xué)”被國務(wù)院首批批準(zhǔn)為碩士學(xué)位授予點，1986年又被批準(zhǔn)為博士學(xué)位授予點。1994年“兒科學(xué)”被江蘇省政府評為省級重點學(xué)科。1999年又被國家教委授予“兒科學(xué)博士后流動站”。1999年7月，撤消兒科系，成立第二臨床醫(yī)學(xué)院。
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2007年1月，為優(yōu)化整合臨床教育資源，提高辦學(xué)效益，在原第二臨床醫(yī)學(xué)院的基礎(chǔ)上，新組建第四臨床醫(yī)學(xué)院，其構(gòu)成為“四院一所”，即附屬腦科醫(yī)院、附屬南京兒童醫(yī)院、附屬南京婦幼保健院、南京醫(yī)科大學(xué)眼科醫(yī)院及兒科醫(yī)學(xué)研究所。其中有三所三級甲等醫(yī)院，學(xué)科力量較強，兒科學(xué)為江蘇省重點學(xué)科，神經(jīng)病學(xué)、精神病與精神衛(wèi)生學(xué)、小兒心胸外科為校級重點學(xué)科。兒科學(xué)、神經(jīng)病學(xué)為博士點，精神衛(wèi)生學(xué)、應(yīng)用心理學(xué)為碩士點。兒科醫(yī)學(xué)研究所下設(shè)兒童保健、小兒腎臟病兩個研究中心，兒童營養(yǎng)、小兒腎臟病的相關(guān)研究處于國內(nèi)一流水平，為保持專業(yè)特色打下了良好基礎(chǔ)。學(xué)院下設(shè)臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)中的四個專業(yè)方向，即兒科醫(yī)學(xué)、精神醫(yī)學(xué)、生殖醫(yī)學(xué)、眼視光。
學(xué)院現(xiàn)有教研室15個,博士生導(dǎo)師4人，碩士生導(dǎo)師47人，教授15人，副教授48人，研究生97人，七年制學(xué)生147人，本科生458人，畢業(yè)生總數(shù)1423人，整體就業(yè)率達96.7%。
