北京大學公共衛(wèi)生學院始建于 1950 年，其前身為北京大學醫(yī)學院公共衛(wèi)生科。 1952 年北京大學醫(yī)學院脫離北京大學獨立建院，公共衛(wèi)生科改為公共衛(wèi)生學系， 1956 年更名為衛(wèi)生系。 1985 年北京醫(yī)學院更名為北京醫(yī)科大學，衛(wèi)生系更名為公共衛(wèi)生學院。 2000 年北京醫(yī)科大學與北京大學合并，組建新的北京大學，北京醫(yī)科大學更名為北京大學醫(yī)學部，公共衛(wèi)生學院為北京大學醫(yī)學部的一部分。公共衛(wèi)生學院培養(yǎng)出的本科生、研究生遍布國內外，大多數(shù)成為預防醫(yī)學、公共衛(wèi)生、衛(wèi)生事業(yè)管理及醫(yī)學教育等領域的中堅和骨干。
公共衛(wèi)生學院設有流行病學與衛(wèi)生統(tǒng)計學、勞動衛(wèi)生與環(huán)境衛(wèi)生學、營養(yǎng)與食品衛(wèi)生學、婦女與兒童青少年衛(wèi)生學、毒理學、衛(wèi)生政策與管理、社會醫(yī)學與健康教育七個系和中心實驗室及北京大學兒童青少年衛(wèi)生研究所。目前全院教職員工 151 人，其中教授、研究員 29 人，副教授、副研究員 28 人，博士研究生導師 9 人。各類在校學生 562 人、其中博士生 59 人、碩士生 183 人、本科生 320 人。
公共衛(wèi)生學院現(xiàn)設有預防醫(yī)學本科專業(yè)， 2001 年起經國家教育部批準，試辦預防醫(yī)學專業(yè)長學制教育，學制 7 年，第六年起進入二級學科培養(yǎng)，畢業(yè)后授予碩士學位。全院有流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學、勞動衛(wèi)生與環(huán)境衛(wèi)生學、營養(yǎng)與食品衛(wèi)生學、兒少衛(wèi)生與婦幼保健學、衛(wèi)生毒理學、社會醫(yī)學與衛(wèi)生事業(yè)管理學六個專業(yè)培養(yǎng)碩士 和 博士研究生。學院有公共衛(wèi)生和預防醫(yī)學博士后科研流動站，可以接受各個學科 畢業(yè) 博士生進站從事科研工作。 2003 年開始招收公共衛(wèi)生碩士（ MPH )。設在學院的預防醫(yī)學培訓部設有預防醫(yī)學專業(yè)成人教育專升本、專科兩個層次的夜大和函授班，以及衛(wèi)生事業(yè)管理專業(yè)專升本電大班。 公共衛(wèi)生學院的流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學為國家重點學科，流行病學實驗室為教育部重點實驗室。學院有循證醫(yī)學中心、艾滋病預防研究中心、營養(yǎng)與保健食品評價中心三個聯(lián)合研究中心及預防醫(yī)學實驗教學中心。近十年來，公共衛(wèi)生學院承擔國家攻關、國家自然科學基金、部委基金和國際合作等科研項目 200 余項。獲各類科研成果獎 50 多項。其科學研究和教育水平在國內公共衛(wèi)生領域處于領先地位。公共衛(wèi)生學院在教學和科研方面與世界衛(wèi)生組織（ WHO )、聯(lián)合國兒童基金會（ UNICEF )、美國疾病控制中心（ CDC )、美國中華醫(yī)學基金會（ CMB )等國際組織保持良好合作關系，并與美國哈佛大學、耶魯大學、約翰·霍普金斯大學，澳大利亞悉尼大學、拉籌伯大學、格里非斯大學，韓國漢城大學，香港中文大學等境外大學建立了良好的交流和合作關系。
