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1.詞語（主題)檢索 在PubMed主頁的提問框中鍵入英文單詞或短語（大寫或小寫均可后回車或點擊“Go”， PubMed即使用其詞匯自動轉換功能進行檢索，并將檢索結果直接顯示在主頁下方。例如：鍵入“vitamin c common cold”后回車或點擊“Go”， PubMed開始檢索并將檢索結果顯示出來。 如果檢索結果不符合要求，可以在提問框中增加或刪除詞語，或者在Details狀態(tài)下（參見Details鍵的用法)來修改檢索式，也可使用“Limits”（參見Limits的用法)選擇限定條件后再進行檢索。此外，用戶可根據需要使用通配符“*”或雙引號進行截詞檢索或強制檢索。
2.著者檢索 在提問框中鍵入著者姓氏全稱和名字的首字母縮寫，格式為：著者姓空格名字首字母縮寫，例如smith ja，然后回車或點擊Go，系統(tǒng)會自動到著者字段去檢索，并顯示檢索結果。 如果在錄入了著者的姓氏，系統(tǒng)將首先在MeSH轉換表中查找該著者的姓論.文.客.服.QQ，81995535。查到后，系統(tǒng)檢索主題字段和題名與文摘字段，否則，系統(tǒng)將在全部字段中檢索。 如果在著者姓名前后使用雙引號，并用著者字段標識——[au]加以限定，如“smith ja”[au]，那么系統(tǒng)只檢索著者字段。
3.刊名檢索 在提問框中鍵入刊名全稱或MEDLINE形式的簡稱、ISSN號，例如：molecular biology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-1524，然后回車或點擊Go,系統(tǒng)將在刊名字段檢索，并顯示檢索結果。如果刊名與MeSH詞表中的詞相同，例如：Gene Therapy、Science或Cell等，PubMed將把這些詞作為MeSH詞檢索。在這種情況下，需要用刊名字段標識——[ta]加以限定，如“gene therapy[ ta ]”。 單個詞的刊名也需要用[ ta ]限定，如：Scanning[ ta ]。否則，系統(tǒng)將在全部字段中檢索。使用刊名全稱或MEDLINE簡稱可檢索到數據庫中的全部相關記錄。使用ISSN號進行檢索，則不能保證檢到數據庫中較早的記錄。 若刊名有括號，錄入時應將括號省略。如：J Hand Surg[ Am ]應鍵入 J Hand Surg Am。
4.布爾邏輯檢索 PubMed系統(tǒng)允許使用布爾邏輯檢索，但要在提問框中鍵入布爾邏輯運算符（AND，OR或NOT)。如：vitamin c OR zinc。
布爾邏輯檢索的運算順序為從左至右，但可使用圓括號來改變其運算順序。如common cold AND (vitamin c OR zinc), 圓括號中的檢索式最先運算。
布爾邏輯檢索允許在檢索詞后附加字段標識以限定檢索字段（字段標識要用方括號括起來，位于檢索詞這后)。其檢索表達式的格式為：檢索詞[字段標識]布爾運算符檢索詞[字段標識]。如：dna[ mh ] AND crick [au ] AND 1993 [ dp ]論.文.客.服.QQ，81995535; 又如：ansthma/therapy[ mh ] AND review[ pt ] AND child, preschool[ mh ]。各種字段標識見表1。
表1 字段標識一覽表 字段標識 字段名稱 簡要說明
AD Affiliation 第一責任者的工作單位、地址，合同號
ALL All Fields 全字段
AU Author Name 著者姓名
RN EC/RN Number 酶學委員會分配給特定酶的編號和化學文獻社的登記號
EDAT Entrez Date 錄入PubMed系統(tǒng)數據庫的日期
FILTER Filter 由PubMed系統(tǒng)鏈接的外部資源站點所使用的用來限
定文獻的技術標識
IP Issue 期刊的期號
TA Journal Title 期刊名稱或IISN號
